Kao pionir razvoja hidroenergetike u Hrvatskoj, Elektroprojekt je sudjelovao u razvoju gotovo cijelog hrvatskog hidroenergetskog sustava u kojem je projektirao većinu hidroelektrana.
Projektiranje hidroenergetskih objekata je jedna od najzastupljenijih djelatnosti Elektroprojekta. Takve je projekte razvijao i razvija i u regiji i u inozemstvu.
To su projektantski poslovi, studije i analize za:
- energetske analize korištenja slivova
- hidroenergetske sustave
- akumulacijske elektrane
- protočne elektrane
- reverzibilne hidroelektrane
- male hidroelektrane
- revitalizacije hidroelektrana
